Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB42P16452 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB42P16452 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB42P16452 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPB42P16452 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPB42P16452 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB42P16452 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB42P16452 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB42P16452 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB42P16452 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB42P16452 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB42P16452 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB42P16452 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB42P16452 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB42P16452 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB42P16452 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB42P16452 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPB42P16452 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPB42P16452 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPB42P16452 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB42P16452 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB42P16452 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB42P16452 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB42P16452 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB42P16452 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPB42P16452 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPB42P16452 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPB42P16452 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPB42P16452 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EPB42P16452 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPB42P16452 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPB42P16452 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPB42P16452 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB42P16452 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB42P16452 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB42P16452 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB42P16452 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB42P16452 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB42P16452 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB42P16452 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB42P16452 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPB42P16452 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EPB42P16452 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPB42P16452 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPB42P16452 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPB42P16452 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPB42P16452 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EPB42P16452 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB42P16452 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB42P16452 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB42P16452 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB42P16452 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB42P16452 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB42P16452 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB42P16452 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB42P16452 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB42P16452 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB42P16452 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB42P16452 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB42P16452 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB42P16452 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB42P16452 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB42P16452 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB42P16452 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB42P16452 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB42P16452 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB42P16452 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB42P16452 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB42P16452 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB42P16452 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB42P16452 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB42P16452 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB42P16452 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB42P16452 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB42P16452 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB42P16452 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB42P16452 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EPB42P16452 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB42P16452 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB42P16452 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB42P16452 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB42P16452 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB42P16452 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB42P16452 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB42P16452 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB42P16452 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB42P16452 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB42P16452 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB42P16452 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB42P16452 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB42P16452 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB42P16452 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB42P16452 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB42P16452 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB42P16452 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB42P16452 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EPB42P16452 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EPB42P16452 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB42P16452 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB42P16452 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms