Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPCAMP16422 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
EPCAMP16422 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
EPCAMP16422 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EPCAMP16422 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EPCAMP16422 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPCAMP16422 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPCAMP16422 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPCAMP16422 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPCAMP16422 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPCAMP16422 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPCAMP16422 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPCAMP16422 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPCAMP16422 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPCAMP16422 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EPCAMP16422 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EPCAMP16422 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPCAMP16422 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EPCAMP16422 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EPCAMP16422 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EPCAMP16422 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPCAMP16422 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EPCAMP16422 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EPCAMP16422 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EPCAMP16422 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
EPCAMP16422 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EPCAMP16422 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EPCAMP16422 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EPCAMP16422 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EPCAMP16422 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
EPCAMP16422 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EPCAMP16422 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
EPCAMP16422 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
EPCAMP16422 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EPCAMP16422 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPCAMP16422 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPCAMP16422 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPCAMP16422 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPCAMP16422 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPCAMP16422 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPCAMP16422 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPCAMP16422 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPCAMP16422 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPCAMP16422 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EPCAMP16422 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPCAMP16422 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPCAMP16422 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPCAMP16422 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPCAMP16422 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EPCAMP16422 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPCAMP16422 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPCAMP16422 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPCAMP16422 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPCAMP16422 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPCAMP16422 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
EPCAMP16422 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPCAMP16422 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPCAMP16422 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPCAMP16422 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPCAMP16422 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms