Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SptbP15508 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SptbP15508 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SptbP15508 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SptbP15508 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SptbP15508 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SptbP15508 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SptbP15508 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SptbP15508 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SptbP15508 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SptbP15508 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SptbP15508 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SptbP15508 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SptbP15508 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SptbP15508 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SptbP15508 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SptbP15508 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SptbP15508 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SptbP15508 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SptbP15508 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SptbP15508 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SptbP15508 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SptbP15508 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SptbP15508 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SptbP15508 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SptbP15508 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SptbP15508 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SptbP15508 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SptbP15508 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SptbP15508 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SptbP15508 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SptbP15508 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SptbP15508 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SptbP15508 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SptbP15508 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SptbP15508 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SptbP15508 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SptbP15508 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SptbP15508 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SptbP15508 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SptbP15508 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SptbP15508 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SptbP15508 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SptbP15508 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SptbP15508 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SptbP15508 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SptbP15508 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SptbP15508 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SptbP15508 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SptbP15508 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SptbP15508 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SptbP15508 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SptbP15508 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SptbP15508 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SptbP15508 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SptbP15508 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SptbP15508 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SptbP15508 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SptbP15508 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SptbP15508 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SptbP15508 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SptbP15508 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SptbP15508 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SptbP15508 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SptbP15508 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SptbP15508 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SptbP15508 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SptbP15508 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SptbP15508 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SptbP15508 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SptbP15508 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SptbP15508 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SptbP15508 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SptbP15508 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SptbP15508 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SptbP15508 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SptbP15508 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SptbP15508 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SptbP15508 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SptbP15508 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SptbP15508 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SptbP15508 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SptbP15508 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SptbP15508 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SptbP15508 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SptbP15508 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SptbP15508 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SptbP15508 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SptbP15508 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SptbP15508 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SptbP15508 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SptbP15508 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SptbP15508 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SptbP15508 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SptbP15508 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SptbP15508 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SptbP15508 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SptbP15508 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SptbP15508 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SptbP15508 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms