Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF2P15336 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF2P15336 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF2P15336 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF2P15336 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATF2P15336 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF2P15336 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF2P15336 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF2P15336 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ATF2P15336 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF2P15336 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATF2P15336 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF2P15336 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF2P15336 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATF2P15336 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF2P15336 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF2P15336 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF2P15336 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF2P15336 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF2P15336 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF2P15336 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF2P15336 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF2P15336 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF2P15336 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATF2P15336 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF2P15336 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF2P15336 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF2P15336 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF2P15336 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF2P15336 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF2P15336 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF2P15336 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF2P15336 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF2P15336 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF2P15336 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF2P15336 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF2P15336 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF2P15336 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF2P15336 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF2P15336 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF2P15336 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF2P15336 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF2P15336 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF2P15336 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF2P15336 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF2P15336 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF2P15336 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF2P15336 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF2P15336 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF2P15336 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF2P15336 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF2P15336 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF2P15336 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF2P15336 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF2P15336 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATF2P15336 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATF2P15336 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATF2P15336 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATF2P15336 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF2P15336 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF2P15336 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF2P15336 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATF2P15336 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATF2P15336 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF2P15336 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF2P15336 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF2P15336 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF2P15336 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF2P15336 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF2P15336 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF2P15336 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF2P15336 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF2P15336 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF2P15336 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF2P15336 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF2P15336 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF2P15336 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATF2P15336 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATF2P15336 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ATF2P15336 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATF2P15336 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF2P15336 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF2P15336 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF2P15336 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF2P15336 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF2P15336 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF2P15336 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF2P15336 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF2P15336 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF2P15336 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATF2P15336 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF2P15336 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF2P15336 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF2P15336 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF2P15336 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATF2P15336 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF2P15336 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF2P15336 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF2P15336 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF2P15336 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms