Protein–RNA interactions for Protein: P15169

CPN1, Carboxypeptidase N catalytic chain, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPN1P15169 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPN1P15169 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPN1P15169 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPN1P15169 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPN1P15169 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPN1P15169 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPN1P15169 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPN1P15169 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPN1P15169 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPN1P15169 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPN1P15169 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPN1P15169 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPN1P15169 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPN1P15169 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPN1P15169 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPN1P15169 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPN1P15169 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPN1P15169 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPN1P15169 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPN1P15169 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CPN1P15169 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPN1P15169 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPN1P15169 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CPN1P15169 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPN1P15169 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPN1P15169 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPN1P15169 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPN1P15169 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPN1P15169 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPN1P15169 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPN1P15169 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPN1P15169 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPN1P15169 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPN1P15169 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPN1P15169 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPN1P15169 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPN1P15169 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPN1P15169 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPN1P15169 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPN1P15169 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CPN1P15169 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CPN1P15169 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CPN1P15169 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPN1P15169 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPN1P15169 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPN1P15169 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPN1P15169 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPN1P15169 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPN1P15169 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPN1P15169 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPN1P15169 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPN1P15169 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPN1P15169 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPN1P15169 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPN1P15169 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPN1P15169 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPN1P15169 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CPN1P15169 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPN1P15169 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPN1P15169 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPN1P15169 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPN1P15169 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPN1P15169 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CPN1P15169 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CPN1P15169 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPN1P15169 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPN1P15169 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPN1P15169 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPN1P15169 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPN1P15169 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPN1P15169 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPN1P15169 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPN1P15169 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPN1P15169 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPN1P15169 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPN1P15169 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPN1P15169 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPN1P15169 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPN1P15169 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPN1P15169 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CPN1P15169 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPN1P15169 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPN1P15169 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPN1P15169 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPN1P15169 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPN1P15169 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPN1P15169 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPN1P15169 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPN1P15169 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CPN1P15169 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CPN1P15169 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CPN1P15169 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CPN1P15169 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CPN1P15169 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CPN1P15169 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CPN1P15169 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CPN1P15169 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CPN1P15169 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPN1P15169 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPN1P15169 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms