Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vpreb1P13372 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vpreb1P13372 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vpreb1P13372 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vpreb1P13372 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vpreb1P13372 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vpreb1P13372 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vpreb1P13372 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vpreb1P13372 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vpreb1P13372 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vpreb1P13372 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vpreb1P13372 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vpreb1P13372 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vpreb1P13372 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vpreb1P13372 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vpreb1P13372 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vpreb1P13372 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vpreb1P13372 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vpreb1P13372 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vpreb1P13372 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vpreb1P13372 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vpreb1P13372 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vpreb1P13372 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vpreb1P13372 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vpreb1P13372 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vpreb1P13372 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vpreb1P13372 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vpreb1P13372 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vpreb1P13372 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vpreb1P13372 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vpreb1P13372 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vpreb1P13372 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms