Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FosbP13346 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FosbP13346 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FosbP13346 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FosbP13346 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FosbP13346 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FosbP13346 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FosbP13346 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FosbP13346 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FosbP13346 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FosbP13346 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FosbP13346 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FosbP13346 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FosbP13346 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FosbP13346 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FosbP13346 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FosbP13346 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FosbP13346 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FosbP13346 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FosbP13346 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FosbP13346 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FosbP13346 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FosbP13346 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FosbP13346 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FosbP13346 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FosbP13346 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FosbP13346 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FosbP13346 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FosbP13346 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FosbP13346 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FosbP13346 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FosbP13346 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FosbP13346 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FosbP13346 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FosbP13346 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FosbP13346 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FosbP13346 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FosbP13346 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FosbP13346 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FosbP13346 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FosbP13346 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FosbP13346 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FosbP13346 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FosbP13346 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FosbP13346 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FosbP13346 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FosbP13346 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FosbP13346 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FosbP13346 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FosbP13346 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FosbP13346 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FosbP13346 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FosbP13346 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FosbP13346 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FosbP13346 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FosbP13346 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FosbP13346 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FosbP13346 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FosbP13346 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FosbP13346 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FosbP13346 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FosbP13346 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FosbP13346 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FosbP13346 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FosbP13346 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FosbP13346 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FosbP13346 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FosbP13346 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FosbP13346 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FosbP13346 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FosbP13346 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FosbP13346 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FosbP13346 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FosbP13346 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
FosbP13346 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FosbP13346 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FosbP13346 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FosbP13346 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FosbP13346 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FosbP13346 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FosbP13346 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FosbP13346 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FosbP13346 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FosbP13346 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FosbP13346 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FosbP13346 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FosbP13346 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FosbP13346 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FosbP13346 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FosbP13346 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FosbP13346 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FosbP13346 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FosbP13346 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FosbP13346 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FosbP13346 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FosbP13346 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FosbP13346 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FosbP13346 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FosbP13346 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FosbP13346 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.8 ms