Protein–RNA interactions for Protein: P12882

MYH1, Myosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH1P12882 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
MYH1P12882 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
MYH1P12882 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
MYH1P12882 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
MYH1P12882 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
MYH1P12882 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
MYH1P12882 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
MYH1P12882 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
MYH1P12882 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
MYH1P12882 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MYH1P12882 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
MYH1P12882 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
MYH1P12882 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
MYH1P12882 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
MYH1P12882 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
MYH1P12882 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
MYH1P12882 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
MYH1P12882 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
MYH1P12882 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
MYH1P12882 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MYH1P12882 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MYH1P12882 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
MYH1P12882 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MYH1P12882 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MYH1P12882 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MYH1P12882 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MYH1P12882 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MYH1P12882 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MYH1P12882 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MYH1P12882 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MYH1P12882 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MYH1P12882 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MYH1P12882 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MYH1P12882 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MYH1P12882 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MYH1P12882 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MYH1P12882 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MYH1P12882 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MYH1P12882 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MYH1P12882 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MYH1P12882 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
MYH1P12882 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MYH1P12882 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MYH1P12882 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MYH1P12882 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MYH1P12882 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MYH1P12882 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MYH1P12882 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MYH1P12882 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MYH1P12882 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MYH1P12882 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
MYH1P12882 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MYH1P12882 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MYH1P12882 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MYH1P12882 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MYH1P12882 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MYH1P12882 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MYH1P12882 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MYH1P12882 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MYH1P12882 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MYH1P12882 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
MYH1P12882 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MYH1P12882 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MYH1P12882 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MYH1P12882 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MYH1P12882 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
MYH1P12882 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MYH1P12882 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MYH1P12882 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MYH1P12882 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MYH1P12882 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MYH1P12882 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MYH1P12882 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MYH1P12882 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MYH1P12882 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MYH1P12882 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
MYH1P12882 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MYH1P12882 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MYH1P12882 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
MYH1P12882 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MYH1P12882 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MYH1P12882 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MYH1P12882 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
MYH1P12882 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
MYH1P12882 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MYH1P12882 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MYH1P12882 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MYH1P12882 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
MYH1P12882 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MYH1P12882 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MYH1P12882 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
MYH1P12882 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
MYH1P12882 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
MYH1P12882 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MYH1P12882 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MYH1P12882 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MYH1P12882 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MYH1P12882 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
MYH1P12882 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MYH1P12882 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms