Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cxcl1P12850 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cxcl1P12850 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcl1P12850 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcl1P12850 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cxcl1P12850 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cxcl1P12850 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcl1P12850 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cxcl1P12850 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcl1P12850 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms