Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ACTN1P12814 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ACTN1P12814 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ACTN1P12814 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ACTN1P12814 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ACTN1P12814 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ACTN1P12814 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ACTN1P12814 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ACTN1P12814 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ACTN1P12814 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ACTN1P12814 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ACTN1P12814 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ACTN1P12814 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ACTN1P12814 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ACTN1P12814 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACTN1P12814 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACTN1P12814 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACTN1P12814 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ACTN1P12814 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACTN1P12814 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ACTN1P12814 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms