Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
COL11A1P12107 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
COL11A1P12107 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
COL11A1P12107 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
COL11A1P12107 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
COL11A1P12107 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
COL11A1P12107 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
COL11A1P12107 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COL11A1P12107 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COL11A1P12107 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
COL11A1P12107 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
COL11A1P12107 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
COL11A1P12107 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
COL11A1P12107 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
COL11A1P12107 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL11A1P12107 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
COL11A1P12107 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
COL11A1P12107 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
COL11A1P12107 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
COL11A1P12107 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
COL11A1P12107 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
COL11A1P12107 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
COL11A1P12107 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
COL11A1P12107 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
COL11A1P12107 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
COL11A1P12107 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
COL11A1P12107 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
COL11A1P12107 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
COL11A1P12107 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
COL11A1P12107 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL11A1P12107 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL11A1P12107 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL11A1P12107 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL11A1P12107 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL11A1P12107 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL11A1P12107 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL11A1P12107 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL11A1P12107 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL11A1P12107 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL11A1P12107 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL11A1P12107 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL11A1P12107 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL11A1P12107 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL11A1P12107 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL11A1P12107 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL11A1P12107 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL11A1P12107 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL11A1P12107 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL11A1P12107 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL11A1P12107 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL11A1P12107 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
COL11A1P12107 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL11A1P12107 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL11A1P12107 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL11A1P12107 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL11A1P12107 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL11A1P12107 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms