Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VPREB1P12018 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB1P12018 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms