Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sub1P11031 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sub1P11031 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sub1P11031 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sub1P11031 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sub1P11031 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sub1P11031 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sub1P11031 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sub1P11031 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sub1P11031 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sub1P11031 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sub1P11031 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sub1P11031 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sub1P11031 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sub1P11031 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sub1P11031 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sub1P11031 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sub1P11031 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sub1P11031 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sub1P11031 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sub1P11031 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sub1P11031 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sub1P11031 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sub1P11031 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sub1P11031 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sub1P11031 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sub1P11031 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms