Protein–RNA interactions for Protein: P10145

CXCL8, Interleukin-8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL8P10145 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CXCL8P10145 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CXCL8P10145 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CXCL8P10145 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CXCL8P10145 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CXCL8P10145 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CXCL8P10145 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CXCL8P10145 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CXCL8P10145 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CXCL8P10145 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CXCL8P10145 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CXCL8P10145 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CXCL8P10145 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCL8P10145 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CXCL8P10145 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCL8P10145 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCL8P10145 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CXCL8P10145 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CXCL8P10145 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CXCL8P10145 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CXCL8P10145 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CXCL8P10145 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL8P10145 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL8P10145 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL8P10145 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL8P10145 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CXCL8P10145 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CXCL8P10145 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CXCL8P10145 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CXCL8P10145 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CXCL8P10145 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CXCL8P10145 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms