Protein–RNA interactions for Protein: P0DMU3

FAM231A/C-like protein LOC102723383, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0DMU3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P0DMU3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P0DMU3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P0DMU3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P0DMU3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P0DMU3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P0DMU3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P0DMU3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P0DMU3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P0DMU3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P0DMU3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P0DMU3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P0DMU3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P0DMU3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P0DMU3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P0DMU3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P0DMU3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P0DMU3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P0DMU3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P0DMU3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P0DMU3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P0DMU3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P0DMU3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P0DMU3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P0DMU3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P0DMU3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P0DMU3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P0DMU3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P0DMU3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P0DMU3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P0DMU3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P0DMU3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P0DMU3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P0DMU3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P0DMU3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P0DMU3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P0DMU3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P0DMU3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P0DMU3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
P0DMU3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P0DMU3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
P0DMU3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P0DMU3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P0DMU3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P0DMU3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
P0DMU3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P0DMU3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
P0DMU3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P0DMU3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
P0DMU3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P0DMU3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P0DMU3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
P0DMU3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P0DMU3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P0DMU3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
P0DMU3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
P0DMU3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
P0DMU3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
P0DMU3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
P0DMU3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
P0DMU3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
P0DMU3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
P0DMU3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P0DMU3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
P0DMU3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
P0DMU3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
P0DMU3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P0DMU3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
P0DMU3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P0DMU3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
P0DMU3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P0DMU3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
P0DMU3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
P0DMU3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P0DMU3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P0DMU3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P0DMU3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
P0DMU3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
P0DMU3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P0DMU3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
P0DMU3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P0DMU3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P0DMU3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P0DMU3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P0DMU3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
P0DMU3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
P0DMU3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P0DMU3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P0DMU3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P0DMU3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P0DMU3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P0DMU3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P0DMU3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P0DMU3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P0DMU3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P0DMU3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P0DMU3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P0DMU3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P0DMU3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P0DMU3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms