Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SRGAP2BP0DMP2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP2BP0DMP2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP2BP0DMP2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRGAP2BP0DMP2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRGAP2BP0DMP2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP2BP0DMP2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP2BP0DMP2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP2BP0DMP2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP2BP0DMP2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP2BP0DMP2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP2BP0DMP2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP2BP0DMP2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP2BP0DMP2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP2BP0DMP2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP2BP0DMP2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP2BP0DMP2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP2BP0DMP2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP2BP0DMP2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP2BP0DMP2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP2BP0DMP2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP2BP0DMP2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP2BP0DMP2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP2BP0DMP2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP2BP0DMP2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP2BP0DMP2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP2BP0DMP2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP2BP0DMP2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP2BP0DMP2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP2BP0DMP2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRGAP2BP0DMP2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP2BP0DMP2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP2BP0DMP2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms