Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CSH2P0DML3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CSH2P0DML3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSH2P0DML3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSH2P0DML3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CSH2P0DML3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSH2P0DML3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSH2P0DML3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSH2P0DML3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSH2P0DML3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSH2P0DML3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSH2P0DML3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSH2P0DML3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CSH2P0DML3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSH2P0DML3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSH2P0DML3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CSH2P0DML3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSH2P0DML3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSH2P0DML3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSH2P0DML3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSH2P0DML3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSH2P0DML3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSH2P0DML3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSH2P0DML3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSH2P0DML3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSH2P0DML3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSH2P0DML3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSH2P0DML3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSH2P0DML3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSH2P0DML3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSH2P0DML3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSH2P0DML3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSH2P0DML3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSH2P0DML3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSH2P0DML3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSH2P0DML3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CSH2P0DML3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSH2P0DML3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSH2P0DML3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSH2P0DML3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSH2P0DML3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSH2P0DML3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSH2P0DML3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSH2P0DML3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSH2P0DML3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSH2P0DML3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSH2P0DML3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSH2P0DML3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSH2P0DML3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSH2P0DML3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms