Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PRR35P0CG20 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRR35P0CG20 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRR35P0CG20 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRR35P0CG20 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRR35P0CG20 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRR35P0CG20 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRR35P0CG20 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRR35P0CG20 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRR35P0CG20 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRR35P0CG20 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRR35P0CG20 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRR35P0CG20 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRR35P0CG20 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRR35P0CG20 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRR35P0CG20 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRR35P0CG20 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRR35P0CG20 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRR35P0CG20 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms