Protein–RNA interactions for Protein: P0C8K7

Smim1, Small integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim1P0C8K7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim1P0C8K7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim1P0C8K7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim1P0C8K7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms