Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CT47B1P0C2W7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CT47B1P0C2W7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CT47B1P0C2W7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CT47B1P0C2W7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CT47B1P0C2W7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CT47B1P0C2W7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CT47B1P0C2W7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CT47B1P0C2W7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CT47B1P0C2W7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CT47B1P0C2W7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CT47B1P0C2W7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CT47B1P0C2W7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CT47B1P0C2W7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CT47B1P0C2W7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CT47B1P0C2W7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CT47B1P0C2W7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CT47B1P0C2W7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CT47B1P0C2W7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CT47B1P0C2W7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CT47B1P0C2W7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CT47B1P0C2W7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CT47B1P0C2W7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CT47B1P0C2W7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CT47B1P0C2W7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CT47B1P0C2W7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CT47B1P0C2W7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CT47B1P0C2W7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CT47B1P0C2W7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CT47B1P0C2W7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CT47B1P0C2W7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CT47B1P0C2W7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CT47B1P0C2W7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CT47B1P0C2W7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CT47B1P0C2W7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CT47B1P0C2W7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CT47B1P0C2W7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CT47B1P0C2W7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CT47B1P0C2W7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CT47B1P0C2W7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CT47B1P0C2W7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CT47B1P0C2W7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CT47B1P0C2W7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CT47B1P0C2W7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CT47B1P0C2W7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CT47B1P0C2W7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CT47B1P0C2W7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CT47B1P0C2W7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CT47B1P0C2W7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CT47B1P0C2W7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CT47B1P0C2W7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CT47B1P0C2W7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CT47B1P0C2W7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CT47B1P0C2W7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CT47B1P0C2W7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CT47B1P0C2W7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CT47B1P0C2W7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CT47B1P0C2W7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CT47B1P0C2W7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CT47B1P0C2W7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CT47B1P0C2W7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CT47B1P0C2W7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CT47B1P0C2W7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CT47B1P0C2W7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CT47B1P0C2W7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CT47B1P0C2W7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CT47B1P0C2W7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CT47B1P0C2W7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CT47B1P0C2W7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CT47B1P0C2W7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CT47B1P0C2W7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CT47B1P0C2W7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CT47B1P0C2W7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CT47B1P0C2W7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CT47B1P0C2W7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CT47B1P0C2W7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CT47B1P0C2W7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CT47B1P0C2W7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CT47B1P0C2W7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CT47B1P0C2W7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CT47B1P0C2W7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms