Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC175P0C221 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC175P0C221 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC175P0C221 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC175P0C221 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC175P0C221 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC175P0C221 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC175P0C221 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC175P0C221 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC175P0C221 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC175P0C221 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC175P0C221 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC175P0C221 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC175P0C221 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC175P0C221 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC175P0C221 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC175P0C221 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC175P0C221 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC175P0C221 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms