Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Surf1P09925 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Surf1P09925 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Surf1P09925 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Surf1P09925 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Surf1P09925 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Surf1P09925 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Surf1P09925 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Surf1P09925 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Surf1P09925 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Surf1P09925 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Surf1P09925 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Surf1P09925 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Surf1P09925 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Surf1P09925 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Surf1P09925 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Surf1P09925 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Surf1P09925 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Surf1P09925 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Surf1P09925 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Surf1P09925 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Surf1P09925 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Surf1P09925 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Surf1P09925 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Surf1P09925 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Surf1P09925 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Surf1P09925 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Surf1P09925 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Surf1P09925 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Surf1P09925 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Surf1P09925 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Surf1P09925 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Surf1P09925 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Surf1P09925 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Surf1P09925 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Surf1P09925 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Surf1P09925 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Surf1P09925 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Surf1P09925 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Surf1P09925 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Surf1P09925 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Surf1P09925 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Surf1P09925 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Surf1P09925 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Surf1P09925 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Surf1P09925 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Surf1P09925 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Surf1P09925 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Surf1P09925 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Surf1P09925 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Surf1P09925 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Surf1P09925 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Surf1P09925 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Surf1P09925 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Surf1P09925 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Surf1P09925 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Surf1P09925 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Surf1P09925 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Surf1P09925 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Surf1P09925 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms