Protein–RNA interactions for Protein: P09813

Apoa2, Apolipoprotein A-II, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa2P09813 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoa2P09813 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apoa2P09813 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa2P09813 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoa2P09813 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoa2P09813 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoa2P09813 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apoa2P09813 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apoa2P09813 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apoa2P09813 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoa2P09813 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoa2P09813 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoa2P09813 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoa2P09813 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoa2P09813 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apoa2P09813 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apoa2P09813 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoa2P09813 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms