Protein–RNA interactions for Protein: P09581

Csf1r, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1rP09581 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Csf1rP09581 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Csf1rP09581 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Csf1rP09581 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Csf1rP09581 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Csf1rP09581 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Csf1rP09581 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Csf1rP09581 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Csf1rP09581 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Csf1rP09581 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Csf1rP09581 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Csf1rP09581 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Csf1rP09581 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Csf1rP09581 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Csf1rP09581 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Csf1rP09581 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Csf1rP09581 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Csf1rP09581 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Csf1rP09581 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Csf1rP09581 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Csf1rP09581 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Csf1rP09581 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Csf1rP09581 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Csf1rP09581 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Csf1rP09581 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Csf1rP09581 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Csf1rP09581 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Csf1rP09581 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Csf1rP09581 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Csf1rP09581 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Csf1rP09581 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Csf1rP09581 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Csf1rP09581 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Csf1rP09581 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Csf1rP09581 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Csf1rP09581 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Csf1rP09581 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Csf1rP09581 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Csf1rP09581 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Csf1rP09581 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Csf1rP09581 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Csf1rP09581 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Csf1rP09581 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Csf1rP09581 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Csf1rP09581 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Csf1rP09581 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Csf1rP09581 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Csf1rP09581 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Csf1rP09581 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Csf1rP09581 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Csf1rP09581 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Csf1rP09581 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Csf1rP09581 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Csf1rP09581 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Csf1rP09581 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Csf1rP09581 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Csf1rP09581 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Csf1rP09581 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Csf1rP09581 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Csf1rP09581 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Csf1rP09581 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Csf1rP09581 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Csf1rP09581 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Csf1rP09581 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Csf1rP09581 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Csf1rP09581 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Csf1rP09581 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Csf1rP09581 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Csf1rP09581 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Csf1rP09581 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Csf1rP09581 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Csf1rP09581 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Csf1rP09581 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Csf1rP09581 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Csf1rP09581 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Csf1rP09581 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Csf1rP09581 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Csf1rP09581 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Csf1rP09581 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Csf1rP09581 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Csf1rP09581 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Csf1rP09581 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Csf1rP09581 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Csf1rP09581 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Csf1rP09581 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Csf1rP09581 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Csf1rP09581 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Csf1rP09581 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Csf1rP09581 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Csf1rP09581 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Csf1rP09581 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Csf1rP09581 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Csf1rP09581 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Csf1rP09581 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Csf1rP09581 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Csf1rP09581 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Csf1rP09581 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Csf1rP09581 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Csf1rP09581 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Csf1rP09581 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms