Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAA1P09110 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAA1P09110 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACAA1P09110 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACAA1P09110 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAA1P09110 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAA1P09110 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAA1P09110 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAA1P09110 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAA1P09110 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAA1P09110 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAA1P09110 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAA1P09110 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAA1P09110 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAA1P09110 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAA1P09110 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAA1P09110 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAA1P09110 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAA1P09110 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACAA1P09110 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms