Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NMBP08949 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NMBP08949 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NMBP08949 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NMBP08949 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NMBP08949 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMBP08949 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMBP08949 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMBP08949 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NMBP08949 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMBP08949 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NMBP08949 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NMBP08949 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NMBP08949 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NMBP08949 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NMBP08949 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NMBP08949 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NMBP08949 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NMBP08949 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMBP08949 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMBP08949 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NMBP08949 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMBP08949 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMBP08949 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NMBP08949 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NMBP08949 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NMBP08949 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMBP08949 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMBP08949 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMBP08949 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMBP08949 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NMBP08949 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NMBP08949 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NMBP08949 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NMBP08949 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMBP08949 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMBP08949 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMBP08949 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMBP08949 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NMBP08949 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NMBP08949 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NMBP08949 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NMBP08949 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NMBP08949 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NMBP08949 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NMBP08949 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMBP08949 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMBP08949 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMBP08949 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMBP08949 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NMBP08949 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NMBP08949 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NMBP08949 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NMBP08949 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBP08949 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBP08949 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBP08949 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBP08949 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBP08949 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBP08949 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBP08949 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMBP08949 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMBP08949 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NMBP08949 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBP08949 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBP08949 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBP08949 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBP08949 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBP08949 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBP08949 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBP08949 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBP08949 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBP08949 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBP08949 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMBP08949 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMBP08949 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMBP08949 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMBP08949 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMBP08949 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMBP08949 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMBP08949 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMBP08949 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMBP08949 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMBP08949 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMBP08949 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMBP08949 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMBP08949 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMBP08949 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMBP08949 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMBP08949 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMBP08949 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMBP08949 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NMBP08949 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NMBP08949 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NMBP08949 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NMBP08949 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMBP08949 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMBP08949 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMBP08949 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMBP08949 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms