Protein–RNA interactions for Protein: P07478

PRSS2, Trypsin-2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS2P07478 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRSS2P07478 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRSS2P07478 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRSS2P07478 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRSS2P07478 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRSS2P07478 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRSS2P07478 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRSS2P07478 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRSS2P07478 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms