Protein–RNA interactions for Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN1P07384 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN1P07384 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN1P07384 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN1P07384 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms