Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK1P06493 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK1P06493 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK1P06493 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK1P06493 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK1P06493 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK1P06493 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK1P06493 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK1P06493 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK1P06493 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK1P06493 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK1P06493 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK1P06493 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK1P06493 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK1P06493 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK1P06493 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK1P06493 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK1P06493 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK1P06493 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK1P06493 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK1P06493 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK1P06493 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK1P06493 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK1P06493 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK1P06493 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK1P06493 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK1P06493 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK1P06493 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK1P06493 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK1P06493 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK1P06493 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK1P06493 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK1P06493 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK1P06493 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK1P06493 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK1P06493 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK1P06493 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK1P06493 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK1P06493 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK1P06493 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK1P06493 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK1P06493 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK1P06493 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK1P06493 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK1P06493 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK1P06493 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK1P06493 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK1P06493 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK1P06493 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK1P06493 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK1P06493 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK1P06493 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK1P06493 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK1P06493 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK1P06493 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK1P06493 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK1P06493 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK1P06493 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CDK1P06493 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK1P06493 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK1P06493 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK1P06493 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK1P06493 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK1P06493 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK1P06493 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK1P06493 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK1P06493 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK1P06493 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK1P06493 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK1P06493 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK1P06493 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK1P06493 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK1P06493 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK1P06493 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK1P06493 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK1P06493 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK1P06493 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK1P06493 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK1P06493 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK1P06493 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK1P06493 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK1P06493 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK1P06493 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK1P06493 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK1P06493 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK1P06493 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK1P06493 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK1P06493 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK1P06493 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK1P06493 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK1P06493 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK1P06493 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK1P06493 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK1P06493 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK1P06493 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK1P06493 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK1P06493 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK1P06493 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK1P06493 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK1P06493 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms