Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP1B1P05026 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP1B1P05026 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP1B1P05026 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1B1P05026 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP1B1P05026 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1B1P05026 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1B1P05026 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1B1P05026 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1B1P05026 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1B1P05026 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1B1P05026 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP1B1P05026 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1B1P05026 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1B1P05026 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1B1P05026 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1B1P05026 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP1B1P05026 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP1B1P05026 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1B1P05026 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1B1P05026 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1B1P05026 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1B1P05026 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1B1P05026 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1B1P05026 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1B1P05026 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1B1P05026 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1B1P05026 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1B1P05026 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1B1P05026 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms