Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGKV3-11P04433 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGKV3-11P04433 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGKV3-11P04433 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGKV3-11P04433 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGKV3-11P04433 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGKV3-11P04433 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGKV3-11P04433 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGKV3-11P04433 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IGKV3-11P04433 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGKV3-11P04433 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGKV3-11P04433 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGKV3-11P04433 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IGKV3-11P04433 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IGKV3-11P04433 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IGKV3-11P04433 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IGKV3-11P04433 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGKV3-11P04433 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGKV3-11P04433 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGKV3-11P04433 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IGKV3-11P04433 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGKV3-11P04433 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGKV3-11P04433 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGKV3-11P04433 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV3-11P04433 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV3-11P04433 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV3-11P04433 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV3-11P04433 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV3-11P04433 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV3-11P04433 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV3-11P04433 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGKV3-11P04433 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGKV3-11P04433 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGKV3-11P04433 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms