Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRB1P04280 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRB1P04280 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRB1P04280 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRB1P04280 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRB1P04280 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRB1P04280 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRB1P04280 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRB1P04280 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRB1P04280 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRB1P04280 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRB1P04280 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRB1P04280 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRB1P04280 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRB1P04280 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRB1P04280 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRB1P04280 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRB1P04280 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRB1P04280 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRB1P04280 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRB1P04280 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRB1P04280 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRB1P04280 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRB1P04280 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRB1P04280 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRB1P04280 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRB1P04280 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRB1P04280 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRB1P04280 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRB1P04280 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRB1P04280 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRB1P04280 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRB1P04280 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRB1P04280 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRB1P04280 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRB1P04280 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRB1P04280 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRB1P04280 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRB1P04280 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRB1P04280 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRB1P04280 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRB1P04280 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRB1P04280 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRB1P04280 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRB1P04280 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRB1P04280 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRB1P04280 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRB1P04280 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRB1P04280 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRB1P04280 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRB1P04280 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRB1P04280 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRB1P04280 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRB1P04280 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRB1P04280 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRB1P04280 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRB1P04280 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRB1P04280 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRB1P04280 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRB1P04280 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRB1P04280 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRB1P04280 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRB1P04280 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRB1P04280 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRB1P04280 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRB1P04280 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRB1P04280 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRB1P04280 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRB1P04280 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRB1P04280 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRB1P04280 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRB1P04280 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRB1P04280 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRB1P04280 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRB1P04280 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRB1P04280 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRB1P04280 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRB1P04280 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRB1P04280 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRB1P04280 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRB1P04280 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRB1P04280 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRB1P04280 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRB1P04280 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRB1P04280 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRB1P04280 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRB1P04280 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRB1P04280 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRB1P04280 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRB1P04280 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRB1P04280 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRB1P04280 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRB1P04280 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRB1P04280 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRB1P04280 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRB1P04280 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRB1P04280 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRB1P04280 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRB1P04280 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRB1P04280 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms