Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMG1P04279 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMG1P04279 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMG1P04279 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMG1P04279 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMG1P04279 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMG1P04279 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMG1P04279 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMG1P04279 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMG1P04279 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMG1P04279 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMG1P04279 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMG1P04279 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMG1P04279 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.5 ms