Protein–RNA interactions for Protein: P04155

TFF1, Trefoil factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF1P04155 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFF1P04155 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFF1P04155 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFF1P04155 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TFF1P04155 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFF1P04155 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFF1P04155 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFF1P04155 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFF1P04155 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFF1P04155 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFF1P04155 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFF1P04155 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFF1P04155 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TFF1P04155 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFF1P04155 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFF1P04155 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFF1P04155 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFF1P04155 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFF1P04155 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFF1P04155 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TFF1P04155 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFF1P04155 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFF1P04155 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFF1P04155 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFF1P04155 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFF1P04155 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TFF1P04155 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFF1P04155 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFF1P04155 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFF1P04155 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFF1P04155 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFF1P04155 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFF1P04155 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFF1P04155 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFF1P04155 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFF1P04155 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFF1P04155 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFF1P04155 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFF1P04155 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFF1P04155 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFF1P04155 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFF1P04155 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFF1P04155 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFF1P04155 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFF1P04155 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFF1P04155 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFF1P04155 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TFF1P04155 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFF1P04155 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFF1P04155 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFF1P04155 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFF1P04155 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFF1P04155 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFF1P04155 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFF1P04155 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFF1P04155 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFF1P04155 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFF1P04155 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFF1P04155 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFF1P04155 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFF1P04155 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFF1P04155 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFF1P04155 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFF1P04155 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFF1P04155 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFF1P04155 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFF1P04155 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFF1P04155 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFF1P04155 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TFF1P04155 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFF1P04155 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFF1P04155 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFF1P04155 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFF1P04155 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFF1P04155 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFF1P04155 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFF1P04155 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFF1P04155 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFF1P04155 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFF1P04155 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFF1P04155 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFF1P04155 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFF1P04155 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFF1P04155 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFF1P04155 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFF1P04155 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TFF1P04155 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFF1P04155 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TFF1P04155 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFF1P04155 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFF1P04155 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF1P04155 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF1P04155 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF1P04155 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF1P04155 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF1P04155 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF1P04155 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF1P04155 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF1P04155 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF1P04155 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms