Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A1P02730 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A1P02730 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A1P02730 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A1P02730 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A1P02730 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A1P02730 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A1P02730 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A1P02730 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A1P02730 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A1P02730 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A1P02730 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A1P02730 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A1P02730 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A1P02730 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A1P02730 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC4A1P02730 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms