Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTA1P02549 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTA1P02549 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTA1P02549 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTA1P02549 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTA1P02549 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTA1P02549 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTA1P02549 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTA1P02549 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTA1P02549 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTA1P02549 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTA1P02549 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTA1P02549 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTA1P02549 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTA1P02549 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTA1P02549 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTA1P02549 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTA1P02549 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTA1P02549 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTA1P02549 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTA1P02549 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTA1P02549 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTA1P02549 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTA1P02549 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTA1P02549 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTA1P02549 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPTA1P02549 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SPTA1P02549 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTA1P02549 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTA1P02549 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTA1P02549 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTA1P02549 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTA1P02549 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTA1P02549 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTA1P02549 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTA1P02549 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTA1P02549 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTA1P02549 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTA1P02549 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTA1P02549 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTA1P02549 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTA1P02549 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTA1P02549 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTA1P02549 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTA1P02549 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms