Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRBC1P01850 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRBC1P01850 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRBC1P01850 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRBC1P01850 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRBC1P01850 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRBC1P01850 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRBC1P01850 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRBC1P01850 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRBC1P01850 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRBC1P01850 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRBC1P01850 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRBC1P01850 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRBC1P01850 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRBC1P01850 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRBC1P01850 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRBC1P01850 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRBC1P01850 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRBC1P01850 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRBC1P01850 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRBC1P01850 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRBC1P01850 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRBC1P01850 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRBC1P01850 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRBC1P01850 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRBC1P01850 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRBC1P01850 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRBC1P01850 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms