Protein–RNA interactions for Protein: P01762

IGHV3-11, Immunoglobulin heavy variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-11P01762 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGHV3-11P01762 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IGHV3-11P01762 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IGHV3-11P01762 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV3-11P01762 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGHV3-11P01762 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGHV3-11P01762 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGHV3-11P01762 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGHV3-11P01762 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGHV3-11P01762 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms