Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01755 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01755 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01755 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01755 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01755 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01755 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01755 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01755 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01755 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01755 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01755 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01755 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01755 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01755 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01755 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01755 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01755 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01755 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01755 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01755 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01755 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01755 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01755 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01755 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01755 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01755 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01755 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01755 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01755 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01755 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01755 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01755 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01755 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01755 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01755 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01755 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01755 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01755 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01755 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01755 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01755 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01755 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01755 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01755 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01755 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01755 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01755 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01755 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01755 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01755 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01755 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01755 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01755 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01755 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01755 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01755 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01755 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01755 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01755 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01755 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01755 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01755 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01755 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01755 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01755 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01755 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01755 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01755 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01755 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01755 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01755 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01755 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01755 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01755 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01755 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01755 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01755 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01755 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01755 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01755 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01755 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01755 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01755 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01755 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01755 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01755 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01755 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01755 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01755 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01755 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01755 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01755 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01755 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01755 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01755 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01755 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01755 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01755 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01755 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms