Protein–RNA interactions for Protein: P01036

CST4, Cystatin-S, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST4P01036 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CST4P01036 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CST4P01036 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CST4P01036 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST4P01036 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST4P01036 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST4P01036 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST4P01036 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST4P01036 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST4P01036 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST4P01036 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST4P01036 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CST4P01036 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CST4P01036 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CST4P01036 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CST4P01036 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CST4P01036 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CST4P01036 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CST4P01036 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CST4P01036 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CST4P01036 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CST4P01036 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CST4P01036 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CST4P01036 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CST4P01036 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CST4P01036 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CST4P01036 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CST4P01036 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CST4P01036 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CST4P01036 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CST4P01036 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CST4P01036 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CST4P01036 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CST4P01036 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CST4P01036 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CST4P01036 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CST4P01036 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CST4P01036 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CST4P01036 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CST4P01036 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CST4P01036 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CST4P01036 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CST4P01036 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CST4P01036 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CST4P01036 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CST4P01036 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CST4P01036 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CST4P01036 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CST4P01036 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CST4P01036 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CST4P01036 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CST4P01036 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CST4P01036 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CST4P01036 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CST4P01036 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CST4P01036 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CST4P01036 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CST4P01036 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CST4P01036 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CST4P01036 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CST4P01036 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CST4P01036 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CST4P01036 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CST4P01036 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CST4P01036 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CST4P01036 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CST4P01036 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CST4P01036 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CST4P01036 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CST4P01036 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CST4P01036 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CST4P01036 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CST4P01036 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CST4P01036 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CST4P01036 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CST4P01036 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CST4P01036 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CST4P01036 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CST4P01036 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CST4P01036 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CST4P01036 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CST4P01036 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CST4P01036 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CST4P01036 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CST4P01036 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CST4P01036 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CST4P01036 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CST4P01036 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CST4P01036 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CST4P01036 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CST4P01036 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CST4P01036 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CST4P01036 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CST4P01036 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CST4P01036 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CST4P01036 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CST4P01036 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CST4P01036 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CST4P01036 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CST4P01036 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms