Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SERPINA1P01009 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERPINA1P01009 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERPINA1P01009 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms