Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPRP00739 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPRP00739 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPRP00739 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPRP00739 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPRP00739 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPRP00739 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPRP00739 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPRP00739 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPRP00739 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPRP00739 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPRP00739 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPRP00739 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HPRP00739 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPRP00739 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPRP00739 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPRP00739 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPRP00739 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPRP00739 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPRP00739 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HPRP00739 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPRP00739 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPRP00739 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPRP00739 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPRP00739 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPRP00739 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPRP00739 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPRP00739 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HPRP00739 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPRP00739 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPRP00739 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPRP00739 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPRP00739 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPRP00739 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPRP00739 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPRP00739 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPRP00739 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPRP00739 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPRP00739 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPRP00739 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPRP00739 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPRP00739 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPRP00739 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPRP00739 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPRP00739 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HPRP00739 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPRP00739 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPRP00739 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPRP00739 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPRP00739 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPRP00739 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HPRP00739 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPRP00739 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HPRP00739 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPRP00739 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HPRP00739 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HPRP00739 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPRP00739 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPRP00739 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPRP00739 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPRP00739 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPRP00739 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPRP00739 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPRP00739 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPRP00739 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPRP00739 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPRP00739 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPRP00739 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPRP00739 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPRP00739 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPRP00739 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPRP00739 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPRP00739 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPRP00739 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPRP00739 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HPRP00739 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPRP00739 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HPRP00739 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HPRP00739 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HPRP00739 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HPRP00739 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HPRP00739 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPRP00739 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPRP00739 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPRP00739 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPRP00739 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPRP00739 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPRP00739 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPRP00739 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HPRP00739 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPRP00739 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPRP00739 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPRP00739 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPRP00739 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPRP00739 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPRP00739 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPRP00739 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPRP00739 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPRP00739 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPRP00739 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms