Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abl1P00520 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abl1P00520 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abl1P00520 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abl1P00520 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Abl1P00520 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abl1P00520 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abl1P00520 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abl1P00520 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abl1P00520 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abl1P00520 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Abl1P00520 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abl1P00520 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Abl1P00520 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abl1P00520 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abl1P00520 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abl1P00520 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Abl1P00520 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abl1P00520 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abl1P00520 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abl1P00520 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abl1P00520 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abl1P00520 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abl1P00520 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abl1P00520 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Abl1P00520 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abl1P00520 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abl1P00520 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abl1P00520 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abl1P00520 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abl1P00520 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Abl1P00520 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abl1P00520 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abl1P00520 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abl1P00520 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abl1P00520 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abl1P00520 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abl1P00520 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Abl1P00520 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abl1P00520 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abl1P00520 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abl1P00520 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abl1P00520 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abl1P00520 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abl1P00520 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abl1P00520 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abl1P00520 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abl1P00520 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abl1P00520 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abl1P00520 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abl1P00520 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abl1P00520 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abl1P00520 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abl1P00520 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abl1P00520 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abl1P00520 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abl1P00520 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abl1P00520 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Abl1P00520 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abl1P00520 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abl1P00520 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abl1P00520 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abl1P00520 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abl1P00520 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abl1P00520 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Abl1P00520 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Abl1P00520 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abl1P00520 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abl1P00520 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abl1P00520 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abl1P00520 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abl1P00520 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abl1P00520 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abl1P00520 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abl1P00520 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abl1P00520 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Abl1P00520 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abl1P00520 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abl1P00520 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abl1P00520 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abl1P00520 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abl1P00520 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abl1P00520 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abl1P00520 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abl1P00520 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abl1P00520 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abl1P00520 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Abl1P00520 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abl1P00520 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abl1P00520 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Abl1P00520 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Abl1P00520 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abl1P00520 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Abl1P00520 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abl1P00520 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abl1P00520 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abl1P00520 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abl1P00520 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abl1P00520 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abl1P00520 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms