Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
F13A1P00488 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
F13A1P00488 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
F13A1P00488 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
F13A1P00488 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
F13A1P00488 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
F13A1P00488 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
F13A1P00488 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
F13A1P00488 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
F13A1P00488 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
F13A1P00488 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30■■■□□ 2.39
F13A1P00488 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
F13A1P00488 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
F13A1P00488 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
F13A1P00488 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
F13A1P00488 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
F13A1P00488 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
F13A1P00488 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
F13A1P00488 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
F13A1P00488 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
F13A1P00488 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
F13A1P00488 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
F13A1P00488 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
F13A1P00488 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
F13A1P00488 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
F13A1P00488 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
F13A1P00488 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
F13A1P00488 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
F13A1P00488 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
F13A1P00488 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
F13A1P00488 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
F13A1P00488 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
F13A1P00488 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
F13A1P00488 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
F13A1P00488 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
F13A1P00488 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
F13A1P00488 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
F13A1P00488 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
F13A1P00488 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
F13A1P00488 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
F13A1P00488 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
F13A1P00488 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
F13A1P00488 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
F13A1P00488 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
F13A1P00488 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
F13A1P00488 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
F13A1P00488 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
F13A1P00488 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
F13A1P00488 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
F13A1P00488 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
F13A1P00488 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
F13A1P00488 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
F13A1P00488 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
F13A1P00488 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
F13A1P00488 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
F13A1P00488 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
F13A1P00488 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
F13A1P00488 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
F13A1P00488 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
F13A1P00488 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
F13A1P00488 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
F13A1P00488 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
F13A1P00488 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
F13A1P00488 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
F13A1P00488 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
F13A1P00488 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
F13A1P00488 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
F13A1P00488 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
F13A1P00488 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
F13A1P00488 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
F13A1P00488 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
F13A1P00488 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
F13A1P00488 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
F13A1P00488 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
F13A1P00488 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
F13A1P00488 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
F13A1P00488 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
F13A1P00488 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
F13A1P00488 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
F13A1P00488 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
F13A1P00488 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
F13A1P00488 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
F13A1P00488 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
F13A1P00488 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
F13A1P00488 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
F13A1P00488 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
F13A1P00488 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
F13A1P00488 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
F13A1P00488 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
F13A1P00488 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
F13A1P00488 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
F13A1P00488 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
F13A1P00488 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
F13A1P00488 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
F13A1P00488 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
F13A1P00488 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
F13A1P00488 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
F13A1P00488 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
F13A1P00488 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
F13A1P00488 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms