Protein–RNA interactions for Protein: P00374

DHFR, Dihydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHFRP00374 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHFRP00374 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHFRP00374 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHFRP00374 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHFRP00374 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHFRP00374 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHFRP00374 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHFRP00374 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHFRP00374 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHFRP00374 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHFRP00374 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHFRP00374 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHFRP00374 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHFRP00374 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHFRP00374 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHFRP00374 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHFRP00374 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHFRP00374 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHFRP00374 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHFRP00374 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DHFRP00374 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHFRP00374 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHFRP00374 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHFRP00374 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHFRP00374 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHFRP00374 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHFRP00374 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHFRP00374 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHFRP00374 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHFRP00374 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHFRP00374 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHFRP00374 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHFRP00374 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHFRP00374 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHFRP00374 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHFRP00374 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHFRP00374 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHFRP00374 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHFRP00374 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHFRP00374 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHFRP00374 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHFRP00374 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHFRP00374 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHFRP00374 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHFRP00374 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHFRP00374 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHFRP00374 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHFRP00374 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHFRP00374 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHFRP00374 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHFRP00374 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHFRP00374 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHFRP00374 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHFRP00374 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHFRP00374 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DHFRP00374 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHFRP00374 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHFRP00374 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHFRP00374 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHFRP00374 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHFRP00374 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHFRP00374 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHFRP00374 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHFRP00374 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHFRP00374 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DHFRP00374 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHFRP00374 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHFRP00374 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHFRP00374 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHFRP00374 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHFRP00374 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHFRP00374 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHFRP00374 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHFRP00374 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHFRP00374 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHFRP00374 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHFRP00374 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHFRP00374 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHFRP00374 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHFRP00374 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHFRP00374 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHFRP00374 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHFRP00374 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHFRP00374 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHFRP00374 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHFRP00374 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHFRP00374 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHFRP00374 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHFRP00374 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHFRP00374 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHFRP00374 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHFRP00374 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHFRP00374 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHFRP00374 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHFRP00374 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHFRP00374 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHFRP00374 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHFRP00374 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHFRP00374 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHFRP00374 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms