Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
APBA3O96018 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
APBA3O96018 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
APBA3O96018 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
APBA3O96018 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
APBA3O96018 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
APBA3O96018 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
APBA3O96018 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
APBA3O96018 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
APBA3O96018 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
APBA3O96018 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
APBA3O96018 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
APBA3O96018 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
APBA3O96018 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
APBA3O96018 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
APBA3O96018 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
APBA3O96018 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
APBA3O96018 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
APBA3O96018 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
APBA3O96018 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
APBA3O96018 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
APBA3O96018 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
APBA3O96018 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
APBA3O96018 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
APBA3O96018 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
APBA3O96018 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
APBA3O96018 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
APBA3O96018 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
APBA3O96018 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
APBA3O96018 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
APBA3O96018 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
APBA3O96018 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
APBA3O96018 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
APBA3O96018 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
APBA3O96018 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
APBA3O96018 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
APBA3O96018 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
APBA3O96018 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
APBA3O96018 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
APBA3O96018 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
APBA3O96018 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
APBA3O96018 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
APBA3O96018 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
APBA3O96018 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
APBA3O96018 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
APBA3O96018 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
APBA3O96018 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
APBA3O96018 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
APBA3O96018 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
APBA3O96018 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
APBA3O96018 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
APBA3O96018 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
APBA3O96018 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
APBA3O96018 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
APBA3O96018 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
APBA3O96018 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
APBA3O96018 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
APBA3O96018 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
APBA3O96018 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
APBA3O96018 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
APBA3O96018 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
APBA3O96018 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
APBA3O96018 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
APBA3O96018 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
APBA3O96018 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
APBA3O96018 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
APBA3O96018 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
APBA3O96018 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
APBA3O96018 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
APBA3O96018 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
APBA3O96018 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
APBA3O96018 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
APBA3O96018 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
APBA3O96018 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
APBA3O96018 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
APBA3O96018 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
APBA3O96018 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
APBA3O96018 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
APBA3O96018 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
APBA3O96018 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
APBA3O96018 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
APBA3O96018 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
APBA3O96018 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
APBA3O96018 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
APBA3O96018 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
APBA3O96018 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
APBA3O96018 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
APBA3O96018 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
APBA3O96018 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
APBA3O96018 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
APBA3O96018 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
APBA3O96018 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
APBA3O96018 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
APBA3O96018 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
APBA3O96018 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
APBA3O96018 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
APBA3O96018 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
APBA3O96018 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
APBA3O96018 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
APBA3O96018 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms