Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
S1PR4O95977 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
S1PR4O95977 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
S1PR4O95977 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
S1PR4O95977 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
S1PR4O95977 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
S1PR4O95977 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
S1PR4O95977 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms