Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MAP4K4O95819 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MAP4K4O95819 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
MAP4K4O95819 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
MAP4K4O95819 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP4K4O95819 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP4K4O95819 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP4K4O95819 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP4K4O95819 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP4K4O95819 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP4K4O95819 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MAP4K4O95819 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MAP4K4O95819 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MAP4K4O95819 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
MAP4K4O95819 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
MAP4K4O95819 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MAP4K4O95819 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MAP4K4O95819 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MAP4K4O95819 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MAP4K4O95819 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MAP4K4O95819 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MAP4K4O95819 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MAP4K4O95819 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
MAP4K4O95819 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MAP4K4O95819 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
MAP4K4O95819 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MAP4K4O95819 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MAP4K4O95819 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MAP4K4O95819 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MAP4K4O95819 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MAP4K4O95819 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
MAP4K4O95819 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
MAP4K4O95819 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
MAP4K4O95819 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
MAP4K4O95819 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
MAP4K4O95819 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
MAP4K4O95819 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MAP4K4O95819 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
MAP4K4O95819 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
MAP4K4O95819 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MAP4K4O95819 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
MAP4K4O95819 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MAP4K4O95819 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MAP4K4O95819 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MAP4K4O95819 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
MAP4K4O95819 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
MAP4K4O95819 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
MAP4K4O95819 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MAP4K4O95819 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MAP4K4O95819 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MAP4K4O95819 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MAP4K4O95819 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MAP4K4O95819 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MAP4K4O95819 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
MAP4K4O95819 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
MAP4K4O95819 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MAP4K4O95819 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MAP4K4O95819 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MAP4K4O95819 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MAP4K4O95819 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MAP4K4O95819 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MAP4K4O95819 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
MAP4K4O95819 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MAP4K4O95819 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
MAP4K4O95819 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MAP4K4O95819 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MAP4K4O95819 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MAP4K4O95819 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MAP4K4O95819 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MAP4K4O95819 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MAP4K4O95819 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MAP4K4O95819 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MAP4K4O95819 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MAP4K4O95819 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MAP4K4O95819 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MAP4K4O95819 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MAP4K4O95819 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MAP4K4O95819 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MAP4K4O95819 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MAP4K4O95819 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MAP4K4O95819 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms