Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPNE6O95741 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPNE6O95741 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPNE6O95741 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPNE6O95741 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPNE6O95741 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPNE6O95741 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPNE6O95741 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPNE6O95741 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPNE6O95741 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPNE6O95741 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPNE6O95741 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPNE6O95741 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPNE6O95741 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPNE6O95741 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms