Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZIC2O95409 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZIC2O95409 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZIC2O95409 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZIC2O95409 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZIC2O95409 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZIC2O95409 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZIC2O95409 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZIC2O95409 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZIC2O95409 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZIC2O95409 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZIC2O95409 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZIC2O95409 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZIC2O95409 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZIC2O95409 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZIC2O95409 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZIC2O95409 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZIC2O95409 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZIC2O95409 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZIC2O95409 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZIC2O95409 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZIC2O95409 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZIC2O95409 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms